Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN2Q12907 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN2Q12907 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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