Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNH2Q12809 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNH2Q12809 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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