Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC173Q0VFZ6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC173Q0VFZ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms