Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
APOBRQ0VD83 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
APOBRQ0VD83 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms