Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL4Q0D2K0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms