Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP4Q09028 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP4Q09028 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms