Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CAMSAP2Q08AD1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CAMSAP2Q08AD1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMSAP2Q08AD1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CAMSAP2Q08AD1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms