Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CD47Q08722 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD47Q08722 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD47Q08722 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD47Q08722 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD47Q08722 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD47Q08722 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD47Q08722 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CD47Q08722 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD47Q08722 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD47Q08722 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD47Q08722 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD47Q08722 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD47Q08722 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD47Q08722 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD47Q08722 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CD47Q08722 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD47Q08722 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CD47Q08722 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD47Q08722 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD47Q08722 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD47Q08722 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD47Q08722 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD47Q08722 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD47Q08722 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD47Q08722 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD47Q08722 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD47Q08722 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD47Q08722 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD47Q08722 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD47Q08722 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD47Q08722 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD47Q08722 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD47Q08722 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD47Q08722 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD47Q08722 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD47Q08722 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD47Q08722 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD47Q08722 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD47Q08722 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD47Q08722 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD47Q08722 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD47Q08722 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD47Q08722 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD47Q08722 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD47Q08722 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD47Q08722 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD47Q08722 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD47Q08722 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD47Q08722 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD47Q08722 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD47Q08722 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CD47Q08722 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD47Q08722 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD47Q08722 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD47Q08722 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD47Q08722 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD47Q08722 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD47Q08722 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD47Q08722 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CD47Q08722 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms