Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM3Q08188 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 737.9 ms