Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 SEH1YGL100W 1050 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 ZRT1YGL255W 1131 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 TFA2YKR062W 987 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YLR118CYLR118C 684 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 EMG1YLR186W 759 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 TIM54YJL054W 1437 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 RAD57YDR004W 1383 nt4.53□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 NUP116YMR047C 3342 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 FUI1YBL042C 1920 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 RAD7YJR052W 1698 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 DOS2YDR068W 933 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YDR336WYDR336W 945 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 SPC3YLR066W 555 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 HRT3YLR097C 1035 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YAR061WYAR061W 204 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 SPO20YMR017W 1194 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 BAG7YOR134W 1230 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 GRE1YPL223C 507 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 snR17bsnR17b 332 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 AME1YBR211C 975 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 CPS1YJL172W 1731 nt4.52□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 PRM2YIL037C 1971 nt4.51□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 TRS23YDR246W 660 nt4.51□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt4.51□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 CBF1YJR060W 1056 nt4.51□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YMR245WYMR245W 621 nt4.51□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 MRP21YBL090W 534 nt4.51□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.51□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 NOB1YOR056C 1380 nt4.51□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 CRT10YOL063C 2874 nt4.51□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 FZO1YBR179C 2568 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 snR63snR63 255 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 PTC1YDL006W 846 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YFL064CYFL064C 525 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 OKP1YGR179C 1221 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 ECM1YAL059W 639 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YLL047WYLL047W 384 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 PSY3YLR376C 729 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 PCL1YNL289W 840 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YPR202WYPR202W 717 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 PRO2YOR323C 1371 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 KRE6YPR159W 2163 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 ADE3YGR204W 2841 nt4.5□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 EMP46YLR080W 1335 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 SAS10YDL153C 1833 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 GET3YDL100C 1065 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 PHO92YDR374C 921 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 CAB1YDR531W 1104 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YER138W-AYER138W-A 105 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 TRX2YGR209C 315 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 RPB4YJL140W 666 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YKL151CYKL151C 1014 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 GSP2YOR185C 663 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YOR318CYOR318C 306 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 HST1YOL068C 1512 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 AXL2YIL140W 2472 nt4.49□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YFT2YDR319C 825 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YDR417CYDR417C 372 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 NPY1YGL067W 1155 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YGR182CYGR182C 354 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 PCT1YGR202C 1275 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YIL089WYIL089W 618 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 SFH5YJL145W 885 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 CTL1YMR180C 963 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YBL077WYBL077W 432 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 RER2YBR002C 861 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 KTR3YBR205W 1215 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YCL041CYCL041C 495 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 AIM10YER087W 1731 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 PAN1YIR006C 4443 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 CNA1YLR433C 1662 nt4.48□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 TFC7YOR110W 1308 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 FAA3YIL009W 2085 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 VID22YLR373C 2706 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 IWR1YDL115C 1062 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 PCL2YDL127W 927 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 COS7YDL248W 1152 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 TRP4YDR354W 1143 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YEL067CYEL067C 588 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 SLO1YER180C-A 258 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 POP6YGR030C 477 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 COS5YJR161C 1152 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 MRPS8YMR158W 468 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 YNG1YOR064C 660 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 PDR10YOR328W 4695 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 NDC1YML031W 1968 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 GCN20YFR009W 2259 nt4.47□□□□□ -1.69
SSK1Q07084 SIR1YKR101W 1965 nt4.46□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 BUD22YMR014W 1560 nt4.46□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 NUP42YDR192C 1293 nt4.46□□□□□ -1.7
SSK1Q07084 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt4.46□□□□□ -1.7
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