Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF9Q07011 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms