Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FMODQ06828 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FMODQ06828 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FMODQ06828 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FMODQ06828 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FMODQ06828 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FMODQ06828 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FMODQ06828 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FMODQ06828 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FMODQ06828 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FMODQ06828 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FMODQ06828 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FMODQ06828 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FMODQ06828 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FMODQ06828 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FMODQ06828 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FMODQ06828 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FMODQ06828 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FMODQ06828 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FMODQ06828 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FMODQ06828 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FMODQ06828 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FMODQ06828 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FMODQ06828 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FMODQ06828 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FMODQ06828 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FMODQ06828 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FMODQ06828 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FMODQ06828 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FMODQ06828 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FMODQ06828 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FMODQ06828 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FMODQ06828 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FMODQ06828 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FMODQ06828 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FMODQ06828 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FMODQ06828 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FMODQ06828 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FMODQ06828 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FMODQ06828 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FMODQ06828 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FMODQ06828 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FMODQ06828 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FMODQ06828 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
FMODQ06828 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FMODQ06828 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FMODQ06828 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FMODQ06828 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FMODQ06828 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
FMODQ06828 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FMODQ06828 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FMODQ06828 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FMODQ06828 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FMODQ06828 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FMODQ06828 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FMODQ06828 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FMODQ06828 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FMODQ06828 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FMODQ06828 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FMODQ06828 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FMODQ06828 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FMODQ06828 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms