Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBQ06643 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBQ06643 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBQ06643 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBQ06643 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBQ06643 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBQ06643 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBQ06643 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBQ06643 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBQ06643 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBQ06643 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBQ06643 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBQ06643 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LTBQ06643 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LTBQ06643 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBQ06643 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBQ06643 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBQ06643 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBQ06643 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBQ06643 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBQ06643 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBQ06643 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBQ06643 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBQ06643 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBQ06643 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBQ06643 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LTBQ06643 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTBQ06643 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBQ06643 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBQ06643 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBQ06643 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBQ06643 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBQ06643 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTBQ06643 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBQ06643 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBQ06643 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBQ06643 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBQ06643 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBQ06643 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBQ06643 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBQ06643 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBQ06643 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBQ06643 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBQ06643 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBQ06643 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBQ06643 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LTBQ06643 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBQ06643 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBQ06643 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBQ06643 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBQ06643 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBQ06643 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBQ06643 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms