Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNG1Q06432 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG1Q06432 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms