Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 BCP1YDR361C 852 nt4.11□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 BNA6YFR047C 888 nt4.11□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 YMR085WYMR085W 1299 nt4.11□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 YCL022CYCL022C 516 nt4.11□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 YOL153CYOL153C 1746 nt4.11□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 NPL6YMR091C 1308 nt4.11□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 VPS73YGL104C 1461 nt4.11□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 PRM10YJL108C 1152 nt4.1□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 AIF1YNR074C 1137 nt4.1□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 ATR1YML116W 1629 nt4.1□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 PHO84YML123C 1764 nt4.09□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 MKS1YNL076W 1755 nt4.09□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 ULS1YOR191W 4860 nt4.09□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 snR7-LsnR7-L 214 nt4.09□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 TYW3YGL050W 822 nt4.09□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 CUZ1YNL155W 825 nt4.09□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 FPK1YNR047W 2682 nt4.09□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 ATG23YLR431C 1362 nt4.09□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 FAR10YLR238W 1437 nt4.09□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 ALG6YOR002W 1635 nt4.09□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 NHX1YDR456W 1902 nt4.09□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 NUP42YDR192C 1293 nt4.08□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 DCV1YFR012W 609 nt4.08□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 BIO2YGR286C 1128 nt4.08□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 NMD3YHR170W 1557 nt4.08□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 ERG3YLR056W 1098 nt4.08□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 ATG17YLR423C 1254 nt4.08□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 URA7YBL039C 1740 nt4.08□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 BSC5YNR069C 1470 nt4.08□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 YPL077CYPL077C 723 nt4.08□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 YDC1YPL087W 954 nt4.08□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 BBC1YJL020C 3474 nt4.08□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 PMT5YDL093W 2232 nt4.07□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 TRF5YNL299W 1929 nt4.07□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 MIS1YBR084W 2928 nt4.07□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 MTC1YJL123C 1437 nt4.07□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 RAD52YML032C 1416 nt4.07□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 MRPL4YLR439W 960 nt4.07□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 SAP30YMR263W 606 nt4.07□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 THS1YIL078W 2205 nt4.07□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 YMR221CYMR221C 1515 nt4.06□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 SRG1SRG1 551 nt4.06□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 ARC1YGL105W 1131 nt4.06□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 DAM1YGR113W 1032 nt4.06□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 YPL191CYPL191C 1083 nt4.06□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 PBN1YCL052C 1251 nt4.06□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 SWI3YJL176C 2478 nt4.06□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 SIS2YKR072C 1689 nt4.06□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 RIA1YNL163C 3333 nt4.06□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 DRN1YGR093W 1524 nt4.05□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 TDA11YHR159W 1515 nt4.05□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 TUB2YFL037W 1374 nt4.05□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 GAD1YMR250W 1758 nt4.05□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 EMP47YFL048C 1338 nt4.05□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 THI13YDL244W 1023 nt4.05□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 LCP5YER127W 1074 nt4.05□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.05□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 THI11YJR156C 1023 nt4.05□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 ELA1YNL230C 1140 nt4.05□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 SLD7YOR060C 774 nt4.05□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 HIS4YCL030C 2400 nt4.04□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 YDL094CYDL094C 510 nt4.04□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 ARF2YDL137W 546 nt4.04□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 PRE9YGR135W 777 nt4.04□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 SOL4YGR248W 768 nt4.04□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 SPO19YPL130W 672 nt4.04□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 RRN11YML043C 1524 nt4.04□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 PRT1YOR361C 2292 nt4.04□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 LAS21YJL062W 2493 nt4.03□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 BUD8YLR353W 1812 nt4.03□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 ASP1YDR321W 1146 nt4.03□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 YJL211CYJL211C 444 nt4.03□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 CBT1YKL208W 816 nt4.03□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 YLR125WYLR125W 411 nt4.03□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 YBR139WYBR139W 1527 nt4.03□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 VID28YIL017C 2766 nt4.03□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 APC1YNL172W 5247 nt4.03□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 CNM67YNL225C 1746 nt4.03□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 ECM32YER176W 3366 nt4.03□□□□□ -1.76
NEJ1Q06148 YND1YER005W 1893 nt4.03□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 PRM7YDL039C 2097 nt4.02□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 THI7YLR237W 1797 nt4.02□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 LOH1YJL038C 660 nt4.02□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 NTR2YKR022C 969 nt4.02□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 DCS2YOR173W 1062 nt4.02□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 HSP26YBR072W 645 nt4.02□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 ATG14YBR128C 1035 nt4.02□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 UMP1YBR173C 447 nt4.02□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 YSH1YLR277C 2340 nt4.02□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 RAD1YPL022W 3303 nt4.02□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 PDR5YOR153W 4536 nt4.02□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 TRS85YDR108W 2097 nt4.01□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 SSH1YBR283C 1473 nt4.01□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 YDL012CYDL012C 324 nt4.01□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 ARO2YGL148W 1131 nt4.01□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 BNS1YGR230W 414 nt4.01□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 NVJ1YHR195W 966 nt4.01□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 YIL171WYIL171W 330 nt4.01□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 RAD27YKL113C 1149 nt4.01□□□□□ -1.77
NEJ1Q06148 PEX22YAL055W 543 nt4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms