Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEUP1Q05D60 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms