Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF11Q05519 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF11Q05519 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms