Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD164Q04900 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD164Q04900 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CD164Q04900 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CD164Q04900 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD164Q04900 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD164Q04900 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD164Q04900 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD164Q04900 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD164Q04900 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD164Q04900 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CD164Q04900 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CD164Q04900 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms