Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 RNY1YPL123C 1305 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YTA6YPL074W 2265 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 RRP45YDR280W 918 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YEL077CYEL077C 3834 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 PRO3YER023W 861 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 RFC2YJR068W 1062 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 ERG3YLR056W 1098 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 IRC14YOR135C 342 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YBR219CYBR219C 384 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 NUP116YMR047C 3342 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 FAA3YIL009W 2085 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 GAS4YOL132W 1416 nt5.57□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 IPI3YNL182C 1668 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 MLF3YNL074C 1359 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 RFA1YAR007C 1866 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 VID30YGL227W 2877 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 ECM32YER176W 3366 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 GCS1YDL226C 1059 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YDR134CYDR134C 411 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 COQ4YDR204W 1008 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 DIN7YDR263C 1293 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YER067C-AYER067C-A 324 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 FRA2YGL220W 363 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YLR326WYLR326W 723 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 PPG1YNR032W 1107 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 HRT1YOL133W 366 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 BAG7YOR134W 1230 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 POL12YBL035C 2118 nt5.56□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 RIM15YFL033C 5313 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 SSK22YCR073C 3996 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 RPT4YOR259C 1314 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 NDC1YML031W 1968 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 GRX6YDL010W 696 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 AIR2YDL175C 1035 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 SUR2YDR297W 1050 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 COX3Q0275 810 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 GON7YJL184W 372 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 CYC1YJR048W 330 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 BLS1YLR408C 369 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 TRP3YKL211C 1455 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 APM2YHL019C 1818 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 STB2YMR053C 2553 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 ABF1YKL112W 2196 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 SKM1YOL113W 1968 nt5.55□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 DAS2YDR020C 699 nt5.54□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 DOS2YDR068W 933 nt5.54□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.54□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 VPS28YPL065W 729 nt5.54□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 RPL21BYPL079W 483 nt5.54□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 PCA1YBR295W 3651 nt5.54□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 AVT3YKL146W 2079 nt5.54□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 HAP1YLR256W 4509 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 DOA1YKL213C 2148 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 KIP2YPL155C 2121 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 PMT4YJR143C 2289 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 VCX1YDL128W 1236 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YDR274CYDR274C 372 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 HSP31YDR533C 714 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YER138W-AYER138W-A 105 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 ARD1YHR013C 717 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 WSS1YHR134W 810 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YLR198CYLR198C 360 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 LEM3YNL323W 1245 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 SFT2YBL102W 648 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YOR024WYOR024W 324 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 SSP2YOR242C 1116 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 SUI3YPL237W 858 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YSA1YBR111C 696 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 HUL4YJR036C 2679 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 YJR015WYJR015W 1533 nt5.53□□□□□ -1.52
CEF1Q03654 TYW1YPL207W 2433 nt5.52□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 KIN28YDL108W 921 nt5.52□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 ADH4YGL256W 1149 nt5.52□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 OKP1YGR179C 1221 nt5.52□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 FSH1YHR049W 732 nt5.52□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 GAT4YIR013C 366 nt5.52□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 PCL1YNL289W 840 nt5.52□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.52□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 SCO1YBR037C 888 nt5.52□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 FRE3YOR381W 2136 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 YAP1YML007W 1953 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 YOR1YGR281W 4434 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 PHO92YDR374C 921 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 UTR4YEL038W 684 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 SAY1YGR263C 1275 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 MRPL6YHR147C 645 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 SNL1YIL016W 480 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 TEF4YKL081W 1239 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 LDB18YLL049W 540 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 DCC1YCL016C 1143 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 ADY3YDL239C 2373 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 TGL4YKR089C 2733 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 SUL2YLR092W 2682 nt5.51□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 GLT1YDL171C 6438 nt5.5□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 NSE3YDR288W 912 nt5.5□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 TRP4YDR354W 1143 nt5.5□□□□□ -1.53
CEF1Q03654 YFR035CYFR035C 345 nt5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 81 ms