Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NUCB1Q02818 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUCB1Q02818 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms