Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SATB1Q01826 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SATB1Q01826 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms