Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MC1RQ01726 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MC1RQ01726 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms