Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFITM3Q01628 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IFITM3Q01628 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFITM3Q01628 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms