Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAP1Q01518 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms