Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF9Q00978 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF9Q00978 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF9Q00978 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF9Q00978 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF9Q00978 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF9Q00978 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF9Q00978 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF9Q00978 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms