Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms