Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAT1AQ00266 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MAT1AQ00266 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MAT1AQ00266 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MAT1AQ00266 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MAT1AQ00266 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MAT1AQ00266 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MAT1AQ00266 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MAT1AQ00266 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAT1AQ00266 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MAT1AQ00266 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAT1AQ00266 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAT1AQ00266 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAT1AQ00266 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAT1AQ00266 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAT1AQ00266 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAT1AQ00266 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAT1AQ00266 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAT1AQ00266 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAT1AQ00266 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAT1AQ00266 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAT1AQ00266 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAT1AQ00266 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MAT1AQ00266 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAT1AQ00266 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAT1AQ00266 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAT1AQ00266 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAT1AQ00266 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAT1AQ00266 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MAT1AQ00266 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MAT1AQ00266 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MAT1AQ00266 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAT1AQ00266 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MAT1AQ00266 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAT1AQ00266 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAT1AQ00266 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAT1AQ00266 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAT1AQ00266 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAT1AQ00266 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAT1AQ00266 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAT1AQ00266 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAT1AQ00266 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAT1AQ00266 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAT1AQ00266 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAT1AQ00266 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAT1AQ00266 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAT1AQ00266 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAT1AQ00266 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAT1AQ00266 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MAT1AQ00266 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAT1AQ00266 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAT1AQ00266 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAT1AQ00266 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAT1AQ00266 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAT1AQ00266 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAT1AQ00266 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAT1AQ00266 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAT1AQ00266 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAT1AQ00266 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAT1AQ00266 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms