Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD3P84022 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD3P84022 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD3P84022 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms