Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CRB1P82279 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CRB1P82279 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CRB1P82279 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CRB1P82279 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CRB1P82279 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CRB1P82279 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CRB1P82279 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CRB1P82279 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CRB1P82279 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CRB1P82279 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CRB1P82279 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CRB1P82279 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CRB1P82279 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CRB1P82279 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CRB1P82279 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CRB1P82279 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CRB1P82279 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CRB1P82279 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CRB1P82279 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CRB1P82279 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CRB1P82279 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CRB1P82279 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CRB1P82279 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CRB1P82279 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CRB1P82279 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CRB1P82279 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CRB1P82279 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CRB1P82279 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CRB1P82279 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CRB1P82279 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRB1P82279 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRB1P82279 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRB1P82279 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRB1P82279 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CRB1P82279 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRB1P82279 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CRB1P82279 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRB1P82279 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRB1P82279 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRB1P82279 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRB1P82279 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CRB1P82279 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CRB1P82279 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CRB1P82279 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CRB1P82279 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CRB1P82279 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CRB1P82279 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CRB1P82279 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CRB1P82279 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRB1P82279 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRB1P82279 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CRB1P82279 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRB1P82279 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRB1P82279 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CRB1P82279 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CRB1P82279 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CRB1P82279 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CRB1P82279 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRB1P82279 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRB1P82279 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRB1P82279 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRB1P82279 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRB1P82279 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRB1P82279 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRB1P82279 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRB1P82279 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRB1P82279 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRB1P82279 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRB1P82279 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRB1P82279 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CRB1P82279 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRB1P82279 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRB1P82279 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRB1P82279 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRB1P82279 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRB1P82279 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRB1P82279 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRB1P82279 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CRB1P82279 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRB1P82279 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRB1P82279 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRB1P82279 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRB1P82279 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRB1P82279 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRB1P82279 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRB1P82279 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CRB1P82279 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CRB1P82279 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CRB1P82279 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CRB1P82279 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CRB1P82279 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRB1P82279 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRB1P82279 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRB1P82279 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRB1P82279 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRB1P82279 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRB1P82279 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CRB1P82279 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CRB1P82279 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms