Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAE1P78406 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAE1P78406 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAE1P78406 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAE1P78406 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAE1P78406 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAE1P78406 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAE1P78406 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAE1P78406 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAE1P78406 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAE1P78406 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAE1P78406 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAE1P78406 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAE1P78406 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAE1P78406 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAE1P78406 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAE1P78406 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAE1P78406 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAE1P78406 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAE1P78406 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAE1P78406 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAE1P78406 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAE1P78406 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAE1P78406 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAE1P78406 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAE1P78406 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAE1P78406 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAE1P78406 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAE1P78406 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAE1P78406 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAE1P78406 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAE1P78406 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAE1P78406 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAE1P78406 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAE1P78406 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAE1P78406 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAE1P78406 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAE1P78406 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAE1P78406 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAE1P78406 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAE1P78406 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAE1P78406 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAE1P78406 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAE1P78406 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAE1P78406 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAE1P78406 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAE1P78406 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAE1P78406 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAE1P78406 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAE1P78406 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAE1P78406 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAE1P78406 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAE1P78406 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAE1P78406 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAE1P78406 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAE1P78406 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAE1P78406 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAE1P78406 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAE1P78406 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms