Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms