Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP2P63027 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms