Protein–RNA interactions for Protein: P62899

RPL31, 60S ribosomal protein L31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL31P62899 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL31P62899 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL31P62899 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL31P62899 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL31P62899 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL31P62899 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL31P62899 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL31P62899 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL31P62899 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL31P62899 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL31P62899 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL31P62899 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL31P62899 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL31P62899 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL31P62899 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL31P62899 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL31P62899 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL31P62899 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL31P62899 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL31P62899 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL31P62899 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL31P62899 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL31P62899 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL31P62899 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL31P62899 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL31P62899 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL31P62899 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL31P62899 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL31P62899 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL31P62899 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL31P62899 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL31P62899 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL31P62899 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL31P62899 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL31P62899 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL31P62899 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL31P62899 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL31P62899 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL31P62899 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL31P62899 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL31P62899 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL31P62899 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL31P62899 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL31P62899 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL31P62899 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL31P62899 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL31P62899 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL31P62899 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL31P62899 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL31P62899 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL31P62899 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL31P62899 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL31P62899 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL31P62899 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL31P62899 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL31P62899 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL31P62899 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL31P62899 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL31P62899 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL31P62899 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms