Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms