Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP6V0D1P61421 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V0D1P61421 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms