Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME3P61289 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME3P61289 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME3P61289 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME3P61289 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME3P61289 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME3P61289 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME3P61289 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME3P61289 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME3P61289 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME3P61289 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME3P61289 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME3P61289 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME3P61289 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME3P61289 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME3P61289 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME3P61289 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME3P61289 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME3P61289 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME3P61289 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME3P61289 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME3P61289 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME3P61289 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME3P61289 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSME3P61289 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME3P61289 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME3P61289 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME3P61289 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME3P61289 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME3P61289 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME3P61289 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME3P61289 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME3P61289 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME3P61289 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME3P61289 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME3P61289 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME3P61289 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME3P61289 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME3P61289 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME3P61289 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME3P61289 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME3P61289 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME3P61289 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME3P61289 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME3P61289 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSME3P61289 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME3P61289 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME3P61289 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME3P61289 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME3P61289 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME3P61289 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME3P61289 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME3P61289 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME3P61289 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME3P61289 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME3P61289 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME3P61289 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME3P61289 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME3P61289 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME3P61289 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME3P61289 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME3P61289 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME3P61289 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME3P61289 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME3P61289 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms