Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPS1P60891 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms