Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCD1P59942 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms