Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OXCT1P55809 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OXCT1P55809 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OXCT1P55809 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms