Protein–RNA interactions for Protein: P55283

CDH4, Cadherin-4, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH4P55283 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH4P55283 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH4P55283 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH4P55283 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH4P55283 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH4P55283 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH4P55283 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH4P55283 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH4P55283 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH4P55283 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH4P55283 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH4P55283 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH4P55283 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH4P55283 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH4P55283 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH4P55283 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH4P55283 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH4P55283 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH4P55283 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH4P55283 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH4P55283 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH4P55283 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH4P55283 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH4P55283 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH4P55283 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH4P55283 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH4P55283 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH4P55283 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH4P55283 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH4P55283 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH4P55283 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH4P55283 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH4P55283 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH4P55283 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH4P55283 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH4P55283 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH4P55283 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH4P55283 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH4P55283 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH4P55283 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH4P55283 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH4P55283 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH4P55283 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH4P55283 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH4P55283 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH4P55283 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH4P55283 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH4P55283 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH4P55283 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH4P55283 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH4P55283 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH4P55283 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH4P55283 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH4P55283 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH4P55283 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH4P55283 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH4P55283 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH4P55283 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH4P55283 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH4P55283 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms