Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD23BP54727 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD23BP54727 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms