Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNA2D1P54289 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D1P54289 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms