Protein–RNA interactions for Protein: P53867

ATG4, Cysteine protease ATG4, yeastyeast

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG4P53867 STM1YLR150W 822 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YLR156WYLR156W 345 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YLR159WYLR159W 345 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YLR161WYLR161W 345 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 TAL1YLR354C 1008 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 IBD2YNL164C 1056 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YNR025CYNR025C 360 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YOR169CYOR169C 465 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YPR153WYPR153W 423 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 VPS5YOR069W 2028 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 PRT1YOR361C 2292 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 OXP1YKL215C 3861 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 SMP1YBR182C 1359 nt5□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YME1YPR024W 2244 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YDL057WYDL057W 987 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 CAD1YDR423C 1230 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YER186CYER186C 921 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 RPS2YGL123W 765 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 GTT1YIR038C 705 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 TTI2YJR136C 1266 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 PRM9YAR031W 897 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 POP8YBL018C 402 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 SPO19YPL130W 672 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YPR071WYPR071W 636 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 ATG14YBR128C 1035 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 PUS9YDL036C 1389 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 RAD57YDR004W 1383 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 CEG1YGL130W 1380 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 TAX4YJL083W 1815 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YLR108CYLR108C 1458 nt4.99□□□□□ -1.61
ATG4P53867 ADE13YLR359W 1449 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 MTC5YDR128W 3447 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YFL042CYFL042C 2025 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 PLP1YDR183W 693 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 CAB1YDR531W 1104 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 MRS1YIR021W 1092 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 CBF1YJR060W 1056 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 PER33YLR064W 822 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 TIS11YLR136C 858 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 PNP1YLR209C 936 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 GAB1YLR459W 1185 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YMR084WYMR084W 789 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 IAH1YOR126C 717 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 POC4YPL144W 447 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YPR123CYPR123C 435 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 RTT106YNL206C 1368 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 PRM2YIL037C 1971 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YRF1-4YLR466W 4149 nt4.98□□□□□ -1.61
ATG4P53867 SRO9YCL037C 1305 nt4.97□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YER148W-AYER148W-A 579 nt4.97□□□□□ -1.61
ATG4P53867 RPC25YKL144C 639 nt4.97□□□□□ -1.61
ATG4P53867 PIN2YOR104W 849 nt4.97□□□□□ -1.61
ATG4P53867 GSP2YOR185C 663 nt4.97□□□□□ -1.61
ATG4P53867 MUM2YBR057C 1101 nt4.97□□□□□ -1.61
ATG4P53867 YPR142CYPR142C 564 nt4.97□□□□□ -1.61
ATG4P53867 STB3YDR169C 1542 nt4.97□□□□□ -1.61
ATG4P53867 ACS2YLR153C 2052 nt4.96□□□□□ -1.61
ATG4P53867 LDB17YDL146W 1476 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 NUD1YOR373W 2556 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 COX26YDR119W-A 201 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 MTQ2YDR140W 666 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 DCV1YFR012W 609 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 PHO86YJL117W 936 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 IRC25YLR021W 540 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 TFS1YLR178C 660 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 VMA6YLR447C 1038 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 END3YNL084C 1050 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 IZH4YOL101C 939 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 ERI1YPL096C-A 207 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 STE50YCL032W 1041 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 MAL11YGR289C 1851 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 TIM54YJL054W 1437 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 UBX2YML013W 1755 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG4P53867 HSP78YDR258C 2436 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG4P53867 GPM2YDL021W 936 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG4P53867 COS7YDL248W 1152 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG4P53867 YDR042CYDR042C 603 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG4P53867 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG4P53867 COS5YJR161C 1152 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG4P53867 MTD1YKR080W 963 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG4P53867 ERG3YLR056W 1098 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG4P53867 YBR013CYBR013C 390 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG4P53867 IDI1YPL117C 867 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG4P53867 SET6YPL165C 1122 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG4P53867 RBD2YPL246C 789 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG4P53867 MLC2YPR188C 492 nt4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23 ms