Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUBP1P53384 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUBP1P53384 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms