Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARFIP2P53365 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFIP2P53365 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms