Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HK3P52790 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HK3P52790 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HK3P52790 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HK3P52790 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HK3P52790 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HK3P52790 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HK3P52790 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HK3P52790 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HK3P52790 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HK3P52790 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HK3P52790 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HK3P52790 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HK3P52790 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HK3P52790 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HK3P52790 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HK3P52790 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HK3P52790 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HK3P52790 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HK3P52790 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HK3P52790 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HK3P52790 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HK3P52790 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HK3P52790 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HK3P52790 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HK3P52790 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HK3P52790 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HK3P52790 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HK3P52790 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HK3P52790 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HK3P52790 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HK3P52790 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HK3P52790 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HK3P52790 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HK3P52790 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HK3P52790 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HK3P52790 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HK3P52790 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HK3P52790 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HK3P52790 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HK3P52790 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HK3P52790 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HK3P52790 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HK3P52790 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HK3P52790 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HK3P52790 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HK3P52790 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HK3P52790 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HK3P52790 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HK3P52790 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HK3P52790 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HK3P52790 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HK3P52790 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HK3P52790 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HK3P52790 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HK3P52790 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HK3P52790 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HK3P52790 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HK3P52790 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HK3P52790 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HK3P52790 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HK3P52790 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HK3P52790 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HK3P52790 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HK3P52790 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HK3P52790 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HK3P52790 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HK3P52790 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HK3P52790 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HK3P52790 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HK3P52790 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HK3P52790 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HK3P52790 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HK3P52790 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HK3P52790 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HK3P52790 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HK3P52790 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HK3P52790 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HK3P52790 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HK3P52790 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HK3P52790 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HK3P52790 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HK3P52790 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HK3P52790 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HK3P52790 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HK3P52790 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HK3P52790 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HK3P52790 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms