Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2A1P52655 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2A1P52655 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms