Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN6P51797 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN6P51797 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms