Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE6CP51160 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE6CP51160 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms