Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IDH3AP50213 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IDH3AP50213 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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